Baxtérie actinomycète
 
Les bactéries intreviennent directement sur les débris de végétaux, sur les cadavres ou les excréments. Photo © DR
 
A 50 centimètres de profondeur, le gramme de terre contient pas moins de 200 000 bactéries d'espèces différentes telles que les azotobacters. Elles se nourrissent de la matière organique morte pour puiser leur énergie et participent au recyclage azoté et carboné en la décomposant. On parle de saprophytisme

Processus de fermentation

Que l'on soit en présence d'air (aérobie) ou non (anaérobie), les bactéries réalisent une fermentation. Elles s'attaquent, dans un premier temps, aux composés facilement biodégradables comme les glucides, les lipides et les protides par le biais d'enzymes.
En respirant, ces micro-organismes font monter la température, elle peut aller jusqu'à 70°C. D'où un roulement entre les différentes bactéries suivant leur capacité à supporter la chaleur.
Au fur et à mesure de l'activité microbienne, le milieu s'appauvrit en oxygène. Des bactéries anaérobies prennent le relais. Elles réduisent près de 70% de la charge de matière organique et libèrent du biogaz tel que le méthane.


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