La VMC double flux fonctionne sur le même principe que la VMC simple flux mais elle est en plus équipée d'un échangeur thermique. Concrètement, en hiver, l'échangeur va récupérer les calories de l'air extrait et les réinjecter dans l'air aspiré pour qu'il soit préchauffé. En été, c'est le contraire et c'est de l'air rafraîchi qui est réinjecté. Ce système est donc plus économe en énergie et permet de filtrer l'air entrant. Il demande néanmoins plus de travaux et il est aussi plus coûteux qu'une VMC simple flux.
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