C'est en juillet 2008, en plein tournage de Transformers 2 : La Revanche, que Shia LaBeouf fait parler de lui dans la case des faits divers avec un accident de voiture, au volant de son gros Ford F150, qui l'obligera à se faire opérer plusieurs fois de la main gauche. Refusant de se soumettre à un contrôle d'alcoolémie alors que la police le soupçonnait d'être en état d'ivresse, il écopa d'un an de suspension automatique du permis de conduire. Il fut finalement reconnu qu'il n'était pas responsable de l'accident.
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