Au sein des lycées, c'est également une réouverture généralisée à deux vitesses qui se profile :

• Dans les départements verts, les lycées généraux, technologiques et professionnels rouvrent la première semaine de juin, avec un accueil des élèves pour au moins un des trois niveaux, et un point sur leur orientation est proposé aux lycéens sous la forme d'entretiens ; en parallèle du lancement d'une campagne d'identification et de prise en charge des élèves décrocheurs dès le 2 juin.
• Dans les trois "zones orange", les établissements professionnels rouvrent en priorité car ils connaissent, selon le Premier ministre, "plus de décrochage" et ont "des besoins particuliers en ce mois de juin". Ils accueilleront avant tout les classes en cours de "certification", autrement dit les élèves en terminale et en CAP.