En septembre 2018, Jean-Pierre Pernaut annonce sur Twitter qu'il est atteint d'un cancer de la prostate. "Je dois m'absenter quelque temps de la présentation du JT de 13H. J'ai en effet subi une intervention chirurgicale pour un cancer de la prostate. Tout va bien." Si les téléspectateurs se sont inquiétés suite à cette annonce et son absence, le journaliste est heureusement revenu guéri et en pleine forme quelques mois plus tard à la tête du journal de TF1.