Il n'existe pour le moment pas de vaccin contre la maladie de Lyme mais les chercheurs étudient cette possibilité. Un vaccin franco-autrichien contre diverses souches bactériennes responsables de la maladie de Lyme est en cours d'évaluation. La commercialisation pourrait intervenir dans un délai de cinq ans en cas de succès des tests. Un autre vaccin avait déjà été commercialisé aux Etats-Unis en 1998 mais avait été retiré du marché en 2002 après des cas de douleurs arthritiques.
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