Pour les opposants, les méga-bassines perpétuent un mode de culture surconsommateur. Florence Habets, directrice de recherche CNRS en hydrométéorologie et Magali Reghezza, géographe et membre du Haut conseil pour le climat, ont estimé sur le site spécialisé Bon Pote que la pratique "occulte une partie substantielle du problème, à savoir, justement, la nature des usages qui sont faits de cette eau". Des méthodes alternatives, à l'instar de l'hydroponie (aquaculture) existent. Des spécialistes affirment qu'elle permet de recycler l'eau "en permanence", "ce qui rend ces systèmes de 90 à 98 % plus économes en eau que l'agriculture traditionnelle" note le site spécialisé Agri City.
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